袁崇焕心知他是有意与自己为难，也曾看到他迫害东林君子时手段之狠辣，为免遭受杀身之祸，只好辞去辽东巡抚一职。

在他辞职不到两个月，朝中发生了一件大事年仅二十二岁的天启帝朱由校因落水受寒，服食丹药，不幸猝死。

由于朱由校膝下无子，大臣们只好迎立年仅十七岁的信王朱由检即位。

在朱由检登基方才一个月的九月下旬，身为瑞亲王的朱常浩与身为桂亲王的朱常瀛觉得已经历经几任皇帝，不宜再继续待在京城，便一同向他请下圣旨，去了各自的封地陕西汉中府与湖广衡州府就藩。

朱由检并非朱由校那样不辨忠奸之人，早就知道魏忠贤的作恶多端，在两位皇叔离京不久，便当众宣布了魏忠贤的十大罪状，并将其发配到凤阳府充军。

而对于与他狼狈为奸的奉圣夫人客印月，则贬至浣衣局为婢。

魏忠贤在做东厂提督的七年间，恶事做尽，心知自己到了凤阳之后必定没有活路，便于半路投缳自尽。

在他死后，客印月被曾遭受过她欺辱的宫人管事笞死于浣衣局，并被移至西直门外的净乐堂焚尸扬灰。

这厢，将魏忠贤的余党清除干净，又给在两年前被其迫害致死的东林君子裴文中、杨涟、左光斗、王之等人平了反，很想振作起来、做个中兴之主的朱由检便听从了朝中众臣的意见，将几个月前辞去辽东巡抚职务的袁崇焕召回朝中，提拔他为兵部尚书，让其负责整个河北、辽东的军务。